全球乳腺癌死亡人數(shù)達到 68 萬例，占全球女性癌癥死亡總數(shù)的 15.5%，成為全球死亡人數(shù)多的女性癌癥。在中國，乳腺癌也是女性新發(fā)癌癥病例數(shù) 多的癌癥，2020 年新發(fā)病例達到了 42 萬。
2020 年全球女性癌癥新發(fā)病例數(shù)和死亡病例數(shù)前十的癌癥類型
小編去搜索發(fā)現(xiàn)乳腺癌相關的文獻數(shù)量大并且逐年攀升，以下 3 篇是在基因組水平的涉及大型乳腺癌隊列易感基因分析、乳腺癌基因組學特征、乳腺癌的多基因風險評估。
文獻 1：11 萬樣本關聯(lián)分析揭示乳腺癌易感基因
標題：11 萬樣本關聯(lián)分析揭示乳腺癌易感基因
時間：2021/2
期刊：The new england journal of medicine（IF 74.699）
單位：國際乳腺癌學會聯(lián)盟
平臺：Targeted DNA sequencing（34 genes）
摘要：乳腺癌易感基因檢測已被廣泛應用，但是對許多基因而言，與乳腺癌的潛在風險推算商不精準，并且缺乏可靠的亞型相關風險推算。國際乳腺癌學會聯(lián)盟對來自 25 個國家 11.3 萬多例女性 34 個基因與乳腺癌風險的關聯(lián)進行了分析。該人群病例 - 對照研究對 34 個可能易感基因大規(guī)模并行測序，將這些基因蛋白質(zhì)截斷變異和罕見錯義變異進行單獨分析，比較全部乳腺癌和各個亞型乳腺癌的比例。全部乳腺癌女性與對照女性相比：5 個基因（ATM、BRCA1、BRCA2、CHEK2、PALB2）蛋白質(zhì)截短變異比例顯著較高（P<0.0001）。4 個基因（BARD1、RAD51C、RAD51D、TP53）蛋白質(zhì)截短變異比例相對較高（P<0.05）。3 個基因（ATM、CHEK2、TP53）罕見錯義變異比例顯著較高（P<0.001）。3 個基因（BRCA1、BRCA2、TP53）致病錯義變異比例顯著較高，與蛋白質(zhì)截短變異比例相似。這項研究的結果定義了在臨床中有用的基因，用于乳腺癌風險的預測，并提供了蛋白質(zhì)截斷變異相關風險的估計及指導遺傳咨詢。
文獻 2：8401 名乳腺癌病例分析易感基因及多基因風險評估
標題：8401 名乳腺癌病例分析易感基因及多基因風險評估
時間：2020/12
期刊：Nature Communications（IF 12.121）
平臺：Illumina / Affymetrix arrays
摘要：乳腺癌多基因風險評分（PRS) 有可能改善風險預測情況，但其在各種臨床情況下的應用信息非常有限。本研究團隊在 FinnGen 研究的 122,978 名女性中發(fā)現(xiàn)了 8401 例乳腺癌病例，PRS 改變了兩種高影響力移碼突變的乳腺癌患病風險。研究發(fā)現(xiàn)在乳腺癌診斷后，PRS 升高的個體發(fā)展為對側(cè)乳腺癌的風險也相應增加，并且 PRS 可以顯著改善其一級女性親屬的風險評估結果。更為詳細的研究顯示，在攜帶 PALB2 c.1592delT 突變的女性和平均 PRS（10-90% 百分位數(shù)）女性的終生患乳腺癌的風險是 55%，而 PRS 評分高的（> 第 90 個百分位數(shù)）風險升到 84%（71-97%），PRS 評分低的（<10 個百分位數(shù)）風險降到 49%（30-68%）。CHEK2 c.1100delC 突變的攜帶者（n=1648）各評分患病風險分別為 29%（27-32%）、59%（52-66%）和 9%（5-14%）。尤其對那些有早發(fā)性乳腺癌家族史的女性，PRS 可以顯著改善風險評估。
文獻 3：轉(zhuǎn)移性乳腺癌的基因組學特征
標題：轉(zhuǎn)移性乳腺癌基因組學特征
時間：2021/2
期刊：Clinical Cancer Research（IF 10.107）
平臺：Targeted DNA sequencing（OncoPanel）
摘要：本研究對 926 例原發(fā)性或轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者（212 例 dnMBC 和 714 例 rMBC）進行靶向 DNA 測序（OncoPanel）。將未經(jīng)治療的 dnMBC 原發(fā)性腫瘤與發(fā)展為 rMBC 的患者中的原發(fā)腫瘤中的單核苷酸變異、拷貝數(shù)變異和腫瘤突變負擔（TMB）與所有 dnMBC 中的 OS 相關性進行比較分析。在按亞型比較原發(fā)性腫瘤時，與 rMBC 相比，MYB 擴增在三陰性 dnMBC 中非常明顯（21.1% vs 0%,P = 0.0005, q = 0.111）。在初級 HR + / HER2 - dnMBC 與 RMBC 的腫瘤中 KMTD2、SETD2 和 PIK3CA 突變更普遍，TP53 和 BRCA1 相對不太普遍。TP53、MYC 和細胞周期通路基因突變 dnMBC 患者的 OS 更短。三陰性 dnMBC 中高 TMB 與更好的 OS 相關（P = 0.041）。未經(jīng)治療的 dnMBC 與發(fā)展為 rMBC 的患者的原發(fā)腫瘤之間的基因組差異可能為 dnMBC 潛在的轉(zhuǎn)移潛力和不同的治療敏感性提供了依據(jù)。dnMBC 較差的 OS 相關結果說明需要新穎的方法來克服當前療法的潛在抗性。
這 3 篇文獻都是基于大樣本量的分析研究，1 篇利用傳統(tǒng)的基因芯片的手段，2 篇利用了性價比極高、使用越來越廣泛的定制基因 panel 測序的手段，從不同角度揭示了乳腺癌的基因組學特征和疾病易感基因的研究成果，為后續(xù)研究和臨床應用提供參考。其他腫瘤研究也有類似情況，或可借鑒其研究思路。特別地，文獻中應用的定制基因 panel 測序因其成本低、個性化的特點受到了越來越多的青睞。
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