從 IPA 的 pathway 富集結(jié)果中不僅可以看到 pathway 的富集顯著性，并且可以得到 pathway 的激活抑制的信息。
IPA—Canonical pathways analysis 介紹
通過 IPA 的 Ingenuity? Knowledge Base 數(shù)據(jù)庫，進(jìn)行 Fisher 高精度檢驗(yàn)得到具有顯著性意義的 pathway。運(yùn)用客戶特定的實(shí)驗(yàn)結(jié)果來計(jì)算每個(gè) pathway 的 z -score 值預(yù)測(cè) pathway 激活或者抑制。
1、差異 mRNA 或者關(guān)注的 mRNA 基因集；
2、物種限于人，大鼠，小鼠；
3、每個(gè)基因有對(duì)應(yīng)的差異倍數(shù)。
1、圖片格式：pathway 柱狀圖；
2、文本格式：pathway 的富集結(jié)果。
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