通過展示不同基因的 ceRNA 的調(diào)控機(jī)制，從中挖掘出實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組不同類型的 ceRNA 機(jī)制，找到特異性的 ceRNA。線代表不同的 microRNA，藍(lán)色為 mRNA，紅色為 circRNA，綠色為 lncRNA。
ceRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)介紹
建立了一個(gè)計(jì)算的機(jī)制來使 circRNA(lncRNA) 作為 ceRNA 來保護(hù) mRNA 不受 miRNA 的降解。基于基因的表達(dá)值，通過回歸模型分析以及種子序列的匹配的方法，建立 microRNA 的海綿吸附作用的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
1、客戶需要提供 microRNA 表達(dá)數(shù)據(jù)（可選），circRNA(lncRNA) 表達(dá)；
2、數(shù)據(jù)（必選），mRNA 表達(dá)數(shù)據(jù)（必選）；
3、每組數(shù)據(jù) 3 個(gè)或 3 個(gè)以上生物學(xué)重復(fù)。
1、圖片文件（Network 圖），包括 png、PDF 格式；
2、Cytocape 文件：可以 cytoscape 打開進(jìn)行細(xì)節(jié)調(diào)整；
3、文本文件：基因之間 ceRNA 調(diào)控關(guān)系，調(diào)控分?jǐn)?shù)，circRNA（lncRNA）microRNA,mRNA 核心調(diào)控關(guān)系的排序。
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